毛周角化病和毛囊角化病有以下不同之处：
第一，两者的发病率不一样，毛周角化病的发病率高，较为常见，而毛囊角化病是一种少见的遗传性疾病。
第二，两者的好发部位不一样，毛周角化病好发于双上臂和双大腿，而毛囊角化病好发于皮脂丰富的部位，如面部、前胸、后背等。
第三，两者的表现不一样，毛周角化病表现为毛囊性的丘疹，丘疹的顶端可见坚硬的角栓，用手摸之有明显的粗糙感，而毛囊角化病表现为坚硬的丘疹，丘疹上覆盖油腻的痂皮，可互相融合。