三天两头咽喉痛可能有以下原因：
1.扁桃体炎。大多数与患者吃辛辣刺激性的食物，或是熬夜上火，口腔不清洁及不卫生等诱发因素有关。扁桃体实质内出现炎症性改变，严重的时候可以出现扁桃体隐窝内脓栓渗出等相关情况，一般会有咽喉部疼痛感，严重的时候会有张口受限、全身发热等相关改变。
2.可能与扁桃体溃疡有关。扁桃体炎症性溃疡可以出现局部疼痛感，多于单侧发生，在吃东西的时候可能更加明显。
3.咽喉炎。有可能与患者抽烟、喝酒等诱因有关系，也可能与患者说话说多了等有关系。临床上会出现咽部充血，咽后壁、舌根部淋巴滤泡增生，这种情况会导致患者出现咽部的疼痛感。