肝脏血管瘤和小肝癌的组织来源不同。肝脏血管瘤属于良性肿瘤，血管瘤来源于正常的组织，是正常的血管发生过度增生导致的。
小肝癌属于恶性肿瘤，肿瘤细胞是在正常细胞的基础上变异导致的，变异的细胞会异常的增生。肝脏血管瘤和小肝癌的临床表现不同，大部分的肝脏血管瘤不会使患者有明显的症状，较大的血管瘤可能会出现肝脏受压迫的症状。
小肝癌主要以局部压迫症状为主，多呈破坏性的生长，可在肝内和全身发生转移。肝脏血管瘤很少会影响人的寿命，小肝癌可以明显的缩短患者的寿命。