会阴下降综合征的治疗分为非手术治疗和手术治疗。非手术治疗主要是养成定时排便的良好习惯，避免过度用力排便，避免每次排便时间过长，最好每次不要超过10分钟，可适当应用纤维制剂帮助排便，从而避免进一步加重盆底肌损害。便秘患者可酌情使用膨胀性泻剂，必要时可灌肠治疗。
对有直肠前壁粘膜脱垂或内痔脱出着可采用硬化剂注射治疗，如果无效果可考虑用胶圈套扎法或手术切除。对已有粪便失禁的患者可采用疗程性的骨盆感应电流刺激疗法进行括约肌锻炼，以改善功能。
如果保守疗法无效，必要时可考虑做肛门修复术。有持续性会阴部疼痛的患者可温水坐浴，每天一次，每次20分钟左右，有时可给予止痛剂，特别严重的可以利多卡因局部封闭治疗。