梅毒和疱疹的区别在于发病的原因、临床症状以及治疗手段上。从发病的原因角度考虑，梅毒是梅毒螺旋体感染，而疱疹则是单纯疱疹病毒感染或者是其他的疱疹病毒感染导致。
从临床角度考虑，梅毒主要造成梅毒一期硬下疳、梅毒二期的玫瑰疹以及相应的脱发现象，个别人会出现嗜睡、烦躁等神经症状。而疱疹则主要以躯体、皮肤表面局限或散在分布的小水疱为主，不会引发脱发，一般也不会出现明显的玫瑰色斑片。
而从治疗角度考虑，梅毒建议选择长效青霉素等抗生素治疗，而疱疹则建议使用盐酸伐昔洛韦等抗病毒类药物进行治疗。