避孕药除了避孕之外也有其它的功效。有一些避孕药物可以调节月经周期，可以治疗多囊卵巢综合征等，长期应用甾体激素避孕药容易使机体的代谢发生改变。
已经有研究表明雌激素可以降低低密度脂蛋白、升高高密度脂蛋白、升高甘油三酯，而孕激素可以降低高密度脂蛋白、降低甘油三酯。
长期应用甾体激素避孕药，可以使患者发生血栓性疾病的风险增加容易使血液高凝状态。避孕药物还可以保护子宫内膜，能够减少子宫内膜癌的发病几率，降低卵巢癌的发病风险。