磷酸奥司他韦胶囊的药物成分在人体内可产生活性代谢物，其对流感病毒的神经氨酸酶可产生抑制作用，使病毒细胞无法从被感染的细胞中释放，从而产生治疗流感的效果。
本药物在临床上主要用来防治儿童或成人甲型和乙型流感。本药物口服后其成分可快速被胃肠道吸收，在肝脏和肠道酯酶作用下，可在短时间内转化为活性代谢产物，使药效能尽快发挥作用。
此外，本药物的成分不受食物影响，所以可以和食物同服。尤其胃肠功能较弱的患者，在进餐时服用本药物，可提高对药物的耐受性。