咬合肌连着耳朵根疼，常见的疾病是颞颌关节紊乱综合征，可以做以下治疗：
1.建议急性期可以做局部的冰敷处理，减轻局部的肿胀。平常慢性期可以做局部的热敷处理，放松局部的肌肉，减轻疼痛的表现。
2.建议吃饭尽量吃软流食，尽量避免咀嚼。平常避免大声说话，避免过度张口。
3.可以上康复理疗科做局部针灸、推拿等物理疗法，减轻不适感。
4.如果疼痛症状非常明显，可以做局部的激素注射治疗，减轻疼痛，也可以口服非甾体的止痛药物对症治疗。
5.如果病变时间比较长，长期迁延不愈，有可能需要做局部的手术，比如关节镜手术处理。