甲状舌管囊肿属于先天性疾病，多为良性囊肿，若要区分是否属于恶性甲状舌管囊肿，需进行切除后判断。
甲状舌管囊肿是因甲状舌管未及时闭合，及甲状舌管胚胎发育异常导致，有轻度、重度之分，若是轻症者发病时无任何明显异常症状，若病情较为严重，囊肿生长过大，可严重影响患者生活，如说话、进食、呼吸等。
甲状舌管囊肿可并发感染，破溃后还可形成甲状舌管瘘，应及时进行手术治疗，否则会有恶变可能。手术时需将囊肿部位和部分舌骨完整切除，若伴有感染症状，需先控制感染。