细针穿刺最主要的风险是吸取的组织量比较小，主要做的是细胞学诊断，通过细胞学不能够获得明确的临床上的病理诊断或者是给出诊断，并不能鉴别出是原位癌还是浸润性的乳腺癌。
这样的情况下有可能就需要进行二次的穿刺或者是进行粗针穿刺，这是细针穿刺最主要的一个不足和风险。细针穿刺之后发生的局部感染或者是脑转移或者是血肿形成的可能性还是比较小的，这种的风险相对比较低。