首先，胃平滑肌瘤多数为良性肿瘤，但有恶变的可能。而胃平滑肌肉瘤则属于胃的恶性肿瘤，良性肿瘤和恶性肿瘤由于肿瘤的性质不同，在肿瘤的大小、肿瘤的形态及肿瘤的生长速度上都不同。如胃平滑肌瘤肿瘤边界清楚，表面光滑、生长速度慢，而胃平滑肌肉瘤则肿块不规则、周围组织有浸润、生长速度会比较快。
也可以通过不同临床表现来进行区别，胃平滑肌瘤早期可无任何不适症状，如果肿瘤增大则可出现溃疡、出血、腹痛等不适，和胃平滑肌肉瘤有类似。
但胃平滑肌肉瘤还可出现食欲减退、消瘦、梗阻、甚至腹腔内转移等并发症。建议及早手术，带病理检查后可以最终明确诊断。