巧克力囊肿也就是子宫内膜异位症，是子宫内膜异位症的一种表现形式，由于囊肿寄生在卵巢上，里面的囊液是巧克力颜色的，故此而得之名。
由于囊壁反复破裂，破裂后的囊内容物刺激到腹膜，导致卵巢邻近组织泛发性粘连，并且影响输卵管的功能，导致不育的可能。
如果为单侧卵巢巧克力囊肿，建议尽快做腹腔镜针吸抽液治疗，然后注入硬化剂，这样使巧克力囊肿萎缩脱落吸收，不影响卵巢功能，不影响怀孕。手术后尽快促排取卵或者可以试管辅助生殖。