主肺动脉间隔缺损超声可以诊断出，但是检出率不是很高，其中缺口的大小、患者的年龄都会受到影响。主要表现为:主动脉与肺动脉之间可见回声中断，范围大小不等，缺损呈窗型或卵圆型；左室长轴观部分病例可显示主动脉后壁走行异常，向左房侧偏转，CDFI在缺损处可见左向右花色分流，分流依缺损大小而不同，缺损小时分流呈湍流，缺损大时分流呈层流;频谱多普勒于缺损或分流处探及连续性或收缩期分流频谱，流速范围60～400cm/s，缺损越大，分流速度越低，缺损小，分流速度高。