小肠镜和肠镜有区别，小肠镜和肠镜的具体做法以及观察的部位都是不同的。
患者做小肠镜可以经过口腔和肛门两个部位进镜，主要是观察小肠内的病变；肠镜主要是指结肠镜，患者做结肠镜时是经过肛门部位进镜，主要是观察结直肠的病变。
小肠镜做法相对复杂，患者术前准备也复杂；结肠镜做法相对容易，一般医院开展结肠镜检查比较多，小肠镜相对少。
如果患者怀疑小肠病变，除了做小肠镜还可以做胶囊内镜检查，胶囊内镜比小肠镜操作相对简单，但有消化道梗阻的患者不能做胶囊镜检查，而且胶囊镜不能取活检做病理检查。