内脏损伤的原因有很多种：
第一，感染引起，感染引起的内脏损伤是临床上最常见的病因之一，有细菌感染、病毒感染、支原体感染、衣原体感染、真菌感染等，所涉及的疾病包括细菌感染性肺炎、肺结核、肺脓肿等。
第二，占位性病变，最常见的是内脏的肿瘤，例如周围性肺癌、中央性肺癌、肝癌、直肠癌等。
第三，外伤，外伤引起的内脏损伤包括气胸、脾破裂、肝破裂、肠穿孔等。
第四，风湿免疫系统疾病引起的内脏损伤，例如狼疮性肺炎、狼疮性肾炎等。
第五，其它原因引起的内脏损伤，比如内分泌系统引起的内脏损伤、血管疾病引起的内脏损伤等。