临床上要确诊结肠癌，可以通过结肠镜的检查获取病理标本，来最终明确组织病理性质，临床可以确诊结肠癌。也可以通过结肠癌的手术治疗，切除手术标本，通过手术标本的组织病理学，以及免疫组化的结果，来确诊结肠癌。
对于确诊结肠癌，还需要做胸腹部的加强CT，以及磁共振的检查，从而可以评估结肠癌病变的侵犯范围，确定结肠癌的临床分期。根据不同的分期，采取不同的治疗措施。
此外，对于有的患者还需要监测血肿瘤标志物的水平，根据肿瘤标志物的水平，来辅助诊断结肠癌，同时可以用于监测结肠癌的病情变化。