小便尿道口疼痛的原因有很多：
首先，如果排尿开始时刺痛十分明显或者存在排尿困难的症状，一般考虑是尿道炎引起的。
其次，如果排尿终末时出现疼痛，同时存在尿急的症状，一般考虑是膀胱炎引起的。
再者，如果排尿末疼痛比较明显，排尿以后依然存在排尿疼痛，一般常见于膀胱结石、尿道结石，以及尿路异物。如果排尿不畅伴随胀痛，如果属于老年患者，一般考虑是前列腺增生。
最后，排尿刺痛或者烧灼痛，需要考虑膀胱炎，假如有尿道口的分泌物，需要考虑淋病感染的可能。