嗜铬细胞瘤的病因是分为不同的类型，不同的病因的。
散发性嗜铬细胞瘤与交感神经副神经节瘤病因未明，目前的病因研究主要集中在遗传性嗜铬细胞瘤与交感神经副神经节瘤方面。有它的遗传性和有家族性的一些特点。
嗜铬细胞瘤是起源于神经脊的嗜铬细胞肿瘤肿瘤细胞主要合成和分泌儿茶酚胺，故又称之为儿茶酚胺分泌瘤。这些肿瘤的绝大多数来源于肾上腺髓质的嗜铬细胞。即通常意义上的嗜铬细胞瘤。来源于肾上腺外，嗜铬组织的肿瘤可分为神经节，神经瘤，副神经结瘤化学感受气流和颈动脉体瘤。可统称为肾上腺外嗜铬细胞瘤。散发性与交感神经副神经节瘤病因是不明确的。
目前病因研究主要集中在遗传性嗜铬细胞瘤，与交感神经副神经节瘤方面。一些基因突变是可以导致遗传性嗜铬细胞瘤副神经节瘤的。另外一部分就是单侧的肾上腺嗜铬细胞瘤多为散发性，而双侧肿瘤多为家族性。肾上腺髓质增生是嗜铬细胞瘤的一个特殊的一个类型。