新生儿听力筛查没有副作用。听筛是通过耳声发射生物电检查，在新生儿睡眠状态下进行快速无创检查，适用于筛查。初筛定在生后3~5天进行，复筛在生后42天。
耳声发射是产生耳蜗的声能经过中耳结构、穿过鼓膜在外耳道记录到，以通过和未通过记录筛查结果。新生儿外耳道有羊水、胎脂残留物会影响耳声发射导致信号减弱，筛查以前先用棉签清理外耳。
如果新生儿烦躁、哭闹或者呼吸道感染、鼻塞等情况下有可能导致假阳性。新生儿听力筛查为后续诊断和干预提供依据。