排便后肛门剧烈疼痛，最可能的原因是肛周脓肿、肛裂或者痔疮导致的。由于人体肛门的神经末梢分布非常丰富，所以，很多肛周的疾病都，可以导致肛门剧烈的疼痛。
最常见的是肛裂，患者可以有排便时肛门剧烈疼痛，有时疼痛有一定的周期性，伴随大便滴鲜血。痔疮中的血栓性外痔和混合痔脱出嵌顿，也可以导致肛门剧烈疼痛，一般不带鲜血，用手可触及肛门部肿胀的肿物。
而肛周脓肿也可以导致排便时肛门疼痛，疼痛的特点是胀痛为主，用手可触及肛周软组织肿起的包块。当脓肿破溃时，疼痛可明显缓解。