肛门出现很痛有多种原因引起，需要做肛门视诊、肛门指诊、肠镜或者肛周磁共振检查。
首先，要到医院的肛肠科，通过外观观察肛门内是否存在有肿物，局部是否有红肿、分泌物、潮湿。其次，再做一个肛门指诊，带上指套伸进患者肛门内，轻轻的触摸直肠内是否存在有息肉、痔疮，肿物的数量和大小，质地是否柔软，活动度如何。
最后，可以做肠镜或肛门镜，在镜下观察直肠黏膜是否存在有充血、水肿，肿物的大小和数量，肿物表面是否存在有糜烂、溃疡，必要时还可以在肠镜下取部分组织进行活检。