载脂蛋白偏低最常见的原因是生理性的因素，和人的饮食习惯有很大的关系。有些人长期吃素食，体内油脂类食物摄入比较少，就会使体内载脂蛋白的数值偏低。
载脂蛋白偏低还可以见于减肥的人群，减肥的人群以素食为主，而且热量摄入比较少，也会使载脂蛋白的含量降低。有一部分人群载脂蛋白降低是发生了肝脏的疾病，肝脏是合成载脂蛋白的主要场所，肝脏受损之后就会使载脂蛋白的合成减少。
口服有些药物也会降低载脂蛋白的水平，比如雌激素、甲状腺激素等。载脂蛋白偏低不需要特殊的治疗，如果出现明显降低要注意查找原因。