肛瘘是可以彻底根治。肛瘘是一种非常常见的肛肠科疾病，常见的形成原因主要是肛周脓肿未及时接受治疗，脓液未能及时排出，外伤感染，其它的炎症感染。
保守的方法不能治疗肛瘘，药物治疗一般没有太大效果，肛瘘的治疗主要依靠手术治疗。一般手术可分为切开术和挂线术，两种手术方法不同，切开术创面比较大，挂线术采用的是物理切割的方法。
要想彻底根治肛瘘，需要彻底的把所有漏管切除干净，复杂性肛瘘如果有遗漏，术后复发的几率非常大。因此，彻底治疗肛瘘应当用超声或者是探针辅助作用下尽量切除干净。