瘊子治疗方法有很多，主要是通过外用的药膏治疗，50%水杨酸软膏或者10%硝酸银溶液，可以进行贴敷治疗，直到瘊子脱落，这种治疗可能会持续数月或者更长的时间。
由于治疗瘊子的药物一般都具有腐蚀性，所以一定要保护好瘊子周围的皮肤，每次用药之前需要局部的软化瘊子周围的皮肤，增加药物效果。治疗瘊子也可以同时使用液氮冷冻或者激光治疗，也可以采用手术治疗，但是瘊子的治疗一般不能保证一定不再复发。
瘊子治疗期间，无论是用药物治疗，物理治疗，还是激光治疗，都要避免沾水，沾水会使局部的皮肤感染。