阴茎皮肤有小疙瘩可以是多种疾病的表现，其中阴茎局部皮肤炎症是最为常见的原因。
因为阴茎既是男性排泄器官，又是生殖器官，在排尿的过程中可能有尿液存留到阴茎上，在性生活时也会有大量阴道分泌物附于阴茎皮肤上。这两种情况下，如未能及时清洗就会使阴茎皮肤清洁度受到明显影响。在患者出现免疫力下降时就可能会发生阴茎皮肤炎症，这时阴茎皮肤就会有小疙瘩形成，其周围皮肤多有红肿表现，触之有疼痛感。需要予以复方多粘菌素软膏等消炎药物治疗。
除此之外，阴茎皮肤发生过敏时也会有小疙瘩形成，常伴有瘙痒症状，但无明显疼痛，需要予以抗过敏治疗。