目前临床上治疗念珠菌的口服药物主要有三种，包括伊曲康唑、氟康唑、酮康唑，不同部位的念珠菌治疗药物也是不一样的。
氟康唑口服药主要是治疗皮肤黏膜出现的念珠菌，治疗周期为半个月。如果遇到系统性的念珠菌，服用剂量就需要增减。具体的治疗周期、剂量，还是要根据患者的临床情况决定。
出现口腔、食管念珠菌的时候，就需要服用伊曲康唑进行治疗，治疗方式较多，需结合实际情况。使用酮康唑治疗念珠菌时需要警惕，因为其存在很强的肝毒性，因此需要定期进行肝功能的监测。