包涵体肌肉病常吃的药物，主要是糖皮质激素，因为这是一种特发性慢性炎症性肌病，往往会累及四肢远端近端肌肉，出现无痛性的肌无力、肌压痛的一些症状。
而且在治疗方面，首选糖皮质激素，比如甲泼尼龙、泼尼松等，对于改善患者症状以及肌力稳定则有一定的效果，还可以联合免疫抑制剂共同治疗，比如甲氨蝶呤、环孢素、环磷酰胺、硫唑嘌呤等等。
如果病情加重，累及吞咽肌出现吞咽困难时，还可以应用大剂量免疫球蛋白静脉输注，也可以通过血浆置换的方法治疗。