叶酸可以预防胎儿畸形，但不能做到完全避免胎儿畸形。
叶酸预防胎儿畸形的类型，属于神经管畸形。孕前口服3个月的叶酸，孕期持续口服叶酸，可以降低胎儿神经管畸形发生的几率。但是，胎儿畸形有很多种类型，胎儿神经管畸形只是其中的一种，有可能会发生颅内的畸形、生殖器的畸形，以及体内器官生长发育的畸形。导致这些畸形的原因，单纯只靠口服叶酸不能避免。
这些畸形发生的原因，有可能跟夫妇染色体有关系；也有可能跟周围生长环境有关系；接触放射线、毒物，也会导致胎儿畸形的发生。