甲状腺手术分为甲状腺全切术和甲状腺部分切除术，前者包括将两侧甲状腺组织及附近淋巴结全部清扫，仅保留甲状旁腺，多见于恶性肿瘤手术。
而后者是指将甲状腺一侧切除，保留对侧，或只是将某侧甲状腺的一部分切除，保留大部分腺体，多见于良性肿瘤。甲状腺全切术后会丧失甲状腺功能，就需要终生服用药物替代甲状腺功能，如终身服用甲状腺素片等。
而如果只是做的部分切除，术后一段时间内需用药维持正常腺体的功能。定期抽血化验，在血液检验结果正常的情况下，可以逐渐减少药量，直至不再进行用药。