肛周脓肿分为非瘘管性脓肿和瘘管性脓肿。肛门周围的硬块感染导致形成的脓肿可能是非瘘管性脓肿，这种脓肿与肛内不相通，治疗起来比较简单。只需将皮肤切开，将脓液进行充分引流即可，而且不易复发。
而瘘管性脓肿不是因肛门周围的硬块感染引起，而是因肛窦感染引起。临床上常见的就是这种脓肿，因其肛内有内口，只行脓肿切开引流术不能将其完全治愈。而进行手术治疗，将内口找到并处理好，这样术后脓肿才不会复发，从而达到根治的目的。
术后注意饮食，保持大便通畅。