肠旋转不良的诊断，需要根据患者的临床症状和影像学等检查进行确诊。
肠旋转不良大多发生于新生儿，是一种先天性的疾病，腹部疼痛是该病最常见的临床表现。由于新生儿无法进行正确表达，所以平时可能会有比较持续性的哭闹、不爱饮食等情况。如果症状比较严重，会有频繁吐奶、大便稀少的情况。症状不典型的新生儿随着年龄的增大，有乏力消瘦、营养不良的全身性表现。
针对出现消化道症状的患儿，进行腹部彩超或CT的检查，一般可以明确诊断。