肾石症早期多数没有明显症状，但也有可能会表现为突然发作的胀痛、钝痛。如果肾石症是发生在肾盂的结石，由于特殊位置加上结石小，症状不是很明显，一般在体格检查时才能够发现。
如果肾石症是发生在肾盂比较大的结石，平时会感觉到腰部有钝痛的症状，在做剧烈运动之后会有血尿。
另外肾石症还有可能会出现感染，当合并感染时症状会比较明显，会在排尿的时候出现明显脓尿，急性发作期还有可能会出现尿频、怕冷、发热、腰痛、尿急、尿痛等症状。