母体免疫排斥，确实也是会导致胚胎停育的。胚胎停育的因素，主要还是胚胎自身染色体突变的可能，这是几率最大的因素之一。
但是其他还有很多因素，会影响到胚胎停育的可能，比如母体有免疫功能异常，或者有血栓前状态的问题，或者存在各种病毒感染的问题。
也有的女性会有血糖高，或者是甲状腺功能异常等，或者女性合并有高热、慢性消耗性疾病等，会影响到胚胎的发育。夫妻双方的染色体异常，或者是精子质量异常，或者畸形精子，也是常常会影响到的。
所以发生了胚胎停育的问题，是要做相应的检查来，明确胚胎停育的原因，并及时终止妊娠。