眼肌瘫痪不一定是因为维生素B1缺乏，眼肌瘫痪也称眼肌麻痹，是各种原因引起眼肌的功能障碍，包括肌肉运动障碍、自主运动、反射运动障碍。
临床上有表瞳孔的改变、散大或缩小、复视、斜视、眼睑或眼球活动障碍，多有感染或脑血管病基础，肿瘤、糖尿病、周围神经病变等可成为眼肌麻痹的诱因，当人体缺乏维生素B1时，神经髓鞘中的磷酸戊糖途径会受影响，容易引起末梢神经炎，可引起眼肌麻痹。
维生素B1缺乏只是引起眼肌瘫痪的一个原因，引起眼肌瘫痪原因很多，如颅内肿瘤、颅内动脉瘤、颅脑损伤，眼肌麻痹的治疗是越早越好，最佳治疗时间是发病之日起3个月之内。