部分早期复极综合征患者也会有症状发生，症状主要表现为自主神经功能紊乱以及心律失常相关的症状。
第一，自主神经功能紊乱，比如出现胸痛，并且疼痛位于心前区，多数呈刺痛改变，疼痛发作的时候可以向肩背部放射，疼痛的发生和情绪激动以及劳累等诱因没有关系，硝酸甘油片不能缓解疼痛。此外，也常常出现头晕、乏力、易疲劳等自主神经功能紊乱相关的症状。
第二，心律失常症状，少数早期复极综合征有可能合并心律失常现象发生，比如引起心脏早搏或者心动过速，症状方面出现心慌、胸闷以及头晕等心律失常相关的症状表现。