睾丸扭转的病因，主要是因为睾丸与精索相连，睾丸比较大，下坠，而精索是细长，当睾丸的活动度增加的时候，细长的精索就会带着睾丸发生扭转。
精索里面有睾丸的动静脉、输精管，当它发生扭转的时候，就会导致睾丸疼痛、缺血，所以睾丸就有可能发生萎缩。
青春期以及青少年及幼儿，他们在夜间睾丸活动比较大，睾丸扭转可能性就大。尤其青春期的时候，因为激素分泌比较多，刺激睾丸移动度大，就容易导致睾丸扭转；再有就是有人有隐睾症状，隐睾鞘突然开放，睾丸在鞘膜囊内来回移动，也会发生睾丸扭转。