出现C-反应蛋白升高的情况，用药之前需要确定病因。
如果是细菌性呼吸道感染，可以选择青霉素或者一代、二代头孢菌素。若是泌尿系统感染、腹腔感染，可以选择三代头孢或者喹诺酮类抗生素进行治疗。
另外，如果是病毒性感染所致，可以选择奥司他韦、利巴韦林等抗病毒药物。强直性脊柱炎等风湿免疫性疾病，在病情活动期也有可能会出现C-反应蛋白升高，这时需要给予镇痛消炎药物以及免疫抑制剂治疗，无需服用抗生素。
此外，脑卒中以及心肌梗死，也可能会使机体处于应激状态，进而表现为C-反应蛋白升高。如果没有合并细菌感染，也无需服用抗生素，此时可以应用调脂药物，以及抗血小板聚集药物治疗。