小便时肛门火辣辣疼，多是肛门疾病、泌尿道感染、输尿管结石等因素引起。
肛门疾病，如痔疮、肛裂、肛窦炎、肛周脓肿等，导致黏液及分泌物从肛门流出，刺激肛门周围发生炎症，受到小便刺激时发生火辣辣疼。
泌尿道感染，如女性妇科炎症、男性前列腺炎等因素引起的，会伴有小便次数增多、排尿急迫、尿道刺痛感等症状。
输尿管结石会堵塞尿道造成排尿不通畅，引起会阴部位出现放射性疼痛，会伴有血尿、排尿疼痛、排尿困难等症状。
小便时肛门火辣辣疼可用高锰酸钾溶液或中药汤剂熏洗、坐浴，必要时到医院就诊，明确诊断后对症治疗。