临床上慢性蝶窦炎的主要并发症是脑积液鼻漏，颈内动脉破裂，视神经损伤。慢性蝶窦炎的治疗方法是，如果单纯的慢性蝶窦炎，没有解剖结构异常，请在医生指导下，使用足量敏感的抗生素激素治疗促进恢复。
如果是经过系统的药物治疗不能改善症状，请积极检查鼻窦磁共振，排除由于解剖结构异常，堵塞蝶窦口导致的慢性蝶窦炎反复发作。必须在全麻鼻内镜下手术，开放蝶窦口促进蝶窦引流，有利于促进慢性蝶炎恢复正常。
避免炎症反复发作，也可以预防并发症的发生。