子宫内膜异位症导致的经期腹痛，大约有60%的人会在整个经期都出现腹痛。子宫内膜异位症经期腹痛是主要症状，典型症状是继发性痛经、进行性加重，疼痛一般在月经来潮时出现并持续至整个经期，还有一小部分患者腹痛表现是持续性下腹痛，在月经期进一步加重。
疼痛一般位于下腹部、腰骶部和盆腔中部，有时还会放射至会阴、肛门和大腿。
疼痛的严重程度和病灶大小并不相符合，临床上往往存在粘连严重的卵巢异位囊肿患者没有疼痛，而盆腔内小的、散在的病灶却可以引起难以忍受的疼痛。