对于皮脂腺囊肿的治疗，主要是根据患者出现这种疾病所表现的炎症的严重程度以及范围来决定。
如果患者的炎症反应不太明显，一般主要是进行消炎治疗，主要是局部外涂一些消炎类的药膏，通常情况下，可以外涂鱼石脂软膏，或者是夫西地酸乳膏等进行消炎，也可以同时配合口服抗生素的，一般可以口服罗红霉素或者口服阿奇霉素等。
但是有的人的炎症反应比较明显，形成明显的化脓，还需要进行手术切开排脓治疗。当然等待这些炎症消退以后，再进行手术切除治疗，将原来的囊肿全部切除，这样就防止形成复发性的炎症反应。