卵巢囊肿可能会引起卵巢的坏死，也可能会引起盆腔的炎症，同时可能会引起不孕症的发生。
因为卵巢囊肿的具体类型不同，所以引起的疾病会有一定差异。而且很多卵巢囊肿比较大的时候，容易出现卵巢囊肿的扭转或者破裂，在囊肿扭转过久的情况下，就会影响到卵巢局部的血供，从而出现卵巢坏死。
如果女性是巧克力囊肿，这时囊肿过大，就可能会导致盆腔内的器官粘连，所以就会引起不孕症的出现，而且还会导致进行性加重的痛经症状。比较大的卵巢巧克力囊肿，有可能排卵会受到影响。