化脓性肉芽肿造成的危害有自身、本身引起的危害，以及对后期造成的影响。自身的危害主要是皮肤表面形成的一种增生样改变，容易出血、破溃、疼痛。
后期如果治疗不及时，有可能会合并细菌感染，引发局部红肿、疼痛。严重者细菌会进入血液循环身体，从而造成菌血症或者是败血症，从而引发发热、头痛、恶心、烦躁，甚至出现休克等症状。
病原体一旦进入淋巴管有可能会引起淋巴管炎时，伤口部位出现一条或多条的红线样改变，伴随着压痛、肿胀，可能还会出现四肢乏力等现象。