小儿便秘是可以吃胃蛋白酶的。胃蛋白酶可以促进胃肠道内蛋白质的分解，利于胃肠的消化和吸收，对于积食、腹胀、消化不良、胃肠功能紊乱的问题可以起到一定的疗效，对小儿便秘也有辅助治疗效果。
因蛋白质的消化吸收不良可减缓肠胃蠕动，加重便秘症状，服用胃蛋白酶最好是需要在医生的指导下。虽然目前无对服用胃蛋白酶不良反应报道，但也不可无原则的盲目服用，服用过多一是增加孩子心理负担，二是造成资源浪费。
小儿出现便秘，平常要多喝水，不要吃辛辣、刺激性的食物，要适当多吃新鲜的蔬菜和水果，尤其是要多吃含有膳食纤维的蔬菜，要养成定时排便的习惯。