比如躯体疾病。很多的躯体疾病，特别是慢性消耗性疾病，比如大脑的肿瘤和癌症，他本身就可以导致体重的减轻，这些需要通过相关的检查，比如脑部的核磁共振确定他的病情之后，对症处理。
然后需要考虑和抑郁症鉴别。抑郁症的患者往往会有食欲减退的特点，但是神经性厌食症的患者，他的食欲是正常的，并且还会有饥饿感，只有在严重的程度，他的患者才会有食欲减退的表现。而且抑郁症的患者并没有明确的肥胖恐惧和体型恐惧。而且神经性厌食症的患者经常会有活动过度，而且是计划好的仪式性的行为，对于食谱和食物的所谓的卡路里有先占观念，这些抑郁症的患者是没有的。
同时，也需要考虑和躯体化障碍以及精神分裂症进行鉴别。在精神分裂症当中是有明显的精神症状，他对于食物的恐怖是因为幻觉妄想着导致，比如担心里面被人下毒，这些和神经性厌食症是有本质的区别的。