人工合成胰岛素除了有治疗血糖的作用之外，也会有一些副作用，最常见的副作用就是低血糖。如果没有合理的控制胰岛素的剂量，或者患者没有合理的进食，都可能会出现注射胰岛素的患者，出现低血糖的情况，严重者会危及生命。
胰岛素其他的副作用，还有注射部位的脂肪萎陷或脂肪结节。有部分患者在注射胰岛素之后，会出现局部有脂肪坑或者部分有结节的一些临床表现，和注射胰岛素相关。
另外还有一些人会对注射胰岛素过敏，这也是胰岛素的副作用。