肛裂理论上讲时间久了有可能会导致癌变，但在临床上这种概率是非常低。
理论上讲，慢性的肛裂由于裂口已经形成慢性溃疡，而无法愈合，而裂口由于长期慢性的炎症刺激，有可能会导致局部组织变性，甚至癌变的可能。
而且慢性肛裂如果其皮肤局部出现愈合，有可能会导致皮下瘘的形成，属于肛瘘的一种，而肛瘘由于会出现反复的流脓、感染，在临床上是有癌变概率，特别是对于一些病史超过10年以上的肛瘘，其癌变概率会有所增加。