运动完脚臭，可以使用温清水洗脚，将脚清洗干净，然后适量地涂抹低浓度的福尔马林溶液，能够使足部保持干燥，减少足部汗腺分泌。
如果足部出汗较多、脚臭是植物神经功能紊乱所引起，还应当在医生的指导下使用调节植物神经功能的药物治疗，比如谷维素、维生素B1等。如果全身出汗也比较多，还伴有脚臭，可以使用阿托品等药物进行改善，能够减少汗多的症状。
如果存在真菌感染，也会导致运动完脚臭，在确诊后应当使用抗真菌等药物进行治疗，比如氟康唑软膏。