宝宝益生菌不可以长期服用。一般服用益生菌主要是宝宝消化不良、腹泻、便秘等情况下，可以在医生的指导下服用一段时间的益生菌，比如双歧杆菌、乳酸菌等调理宝宝的肠道菌群，提高消化功能，从而促进病情的好转。
当宝宝病情好转以后，即可停止服用益生菌，因为长期服用益生菌，会导致依赖性或者成瘾。
而且长期服用益生菌也会给宝宝的肠道发育起到一定的抑制作用，肠道里面的有益菌就会依赖于口服的益生菌进行补充，对于宝宝的身体健康是没有好处的，所以在病情好转后要及时停用。