绝大多数心房梗死为冠状动脉粥样硬化性心脏病所致。此外慢性阻塞性肺疾病合并肺心病，原发性肺动脉高压、肌营养不良、遗传性运动失调症等，也可引起心房梗死；一些冠状动脉正常的患者发生心肌梗死很可能是低氧血症及心房压力过大、容量负荷过重所致。
对于单纯心房心肌梗死患者，无论有无心室受累表现，都应得到同合并心室心肌梗死一样的处理。
由于心房心肌梗死时血流动力学改变类似右室梗死，因此在血流动力学监测下，补充血容量，可得到有益效果。
对于心房心肌梗死的常见室上性快速心律失常，则选用ⅠA类抗心律失常药物治疗或预防，而维拉帕米、地高辛、β受体阻滞药等亦可用于减慢心率。
由于患者的栓塞发生率高，对心房心肌梗死的严重并发症应争取及早诊断，并行外科修补术。
值得注意的是，经右锁骨下静脉放置起搏电极，易致心房破裂，且心房梗死，多发生于右侧，故该侧导管术应视为相对禁忌。